ДНК: Код жыцця

На самым чароўным сходзе SHA2017 я выступіў з дзвюма прэзентацыямі: "ДНК: Код жыцця" і наступныя творы: "ДНК: Больш за ўсіх хітоў" (слайды). Першую прэзентацыю запісаў выдатны струменевы экіпаж CCC C3VOC, другі - мой сябар Барт Сміт (які таксама цудоўна). Не рабіўшы гэты пост занадта доўгім, хачу падзякаваць усім, хто дапамог мне зрабіць гэтую прэзентацыю - шмат людзей уносілі час, парады, здольнасці да запісу, вялікія пытанні і энтузіязм. Акрамя таго, без чароўнай абстаноўкі SHA2017 гэта ніколі не было б!

Пасля знаёмства з тым, як ДНК працуе (больш ці менш), аргумент прэзентацый такі: ДНК у жывой клетцы - гэта вылічальнае асяроддзе, якое можа быць карысна апісана, зразумета і вывучана з выкарыстаннем камп'ютэрнай тэрміналогіі. Я, вядома, не кажу, што там працэсар добрасумленна выконвае цыклы! Я сапраўды кажу, што ў яго ёсць усе элементы, якія мы выкарыстоўваем у праграмаванні, каб зрабіць усё, што трэба.

Гэты кароткі пост у блогу прызначаны для тых з вас, каму трэба пераканаўча перагледзець дзве гадзіны відэа. Звярніце ўвагу, што без апавяданняў слайды не маюць вялікага сэнсу. Абодва відэа звязаны ніжэй.

За выключэннем аднаго выразна пазначанага слайда, нічога ў гэтых прэзентацыях ніякім чынам не з'яўляецца супярэчлівым, і на самой справе ўсіх прысутных біёлагаў (> 7) запрасілі перапыніць момант, калі яны палічылі, што нешта не так. На маё шчасце, яны не адчувалі патрэбы!

Відэа з часткай 1 знаходзіцца тут (арыгінал), копія YouTube:

Некаторыя ключавыя рэчы:

  • ДНК сапраўды лічбавая, 2 біты на нуклеатыд, 100 мегабайт ДНК для слоічкаў, 750 МБ для чалавека, 5 кілабайт для віруса
  • Цалкам сумяшчальны, атама для атама, на працягу ўсяго жыцця
  • Дзе запампаваць геном чалавека і як ён выглядае на дыску, а таксама тое, што там знаходзіцца.
  • Што такое ген (.o файл), а не - і бульба мае больш генаў, чым вы
  • Спіраль ДНК унутрана залішняя, як масіў RAID1, а акрамя таго, запасная спіраль таксама ёсць. За выключэннем выпадкаў, а потым і некаторых прыкладаў, якія наступствы гэта
  • Як ДНК ставіцца да РНК, ставіцца да бялкоў
  • Выдатны 3D-прынтэр у нашых клетках (Ribosome), які стварае вавёркі з ДНК і 21 амінакіслотнага будаўнічага блока, і як 3 нуклеатыдаў ДНК адлюстроўваюць гэтыя будаўнічыя блокі ("табліца кодона")
  • Функцыя выклікае: як ДНК інсуліну пераўтвараецца ў препроинсулин (так) і пасылае сігнал рэцэптару інсуліну, і чаму гэта надзвычай вылічальная задача
  • Як бактэрыі выкарыстоўваюць ДНК і вавёркі для рэалізацыі заявы if / else if / else для рэгулявання ўзроўню глюкозы з дапамогай булевай логікі ("Lac operon")
  • Як адна бактэрыя рэалізуе просты алгарытм з ДНК, каб знайсці ежу
  • Тры дамены жыцця і іх падазронае паходжанне, і як зліліся два арыгінальныя дамены, каб стварыць нас, расліны, грыбы і г.д., і як мы ведаем
  • Як ДНК робіць (глупства) паўторнае выкарыстанне кода і фільмы пра гэта (фрагменты Оказакі)
  • Крыху пра CRISPR, генетычную дактыласкапію, як у першай секвенцыі геному быў адзін хлопец, які заснаваў кансорцыум
  • Як біялагічныя вірусы сапраўды робяць тое ж самае, што і пры выкарыстанні кампутараў і запуску чарвякоў.
  • RNA-SEQ: бягучая верхняя частка (1) на жывой вочку
  • Тона Q & A

Атрымлівайце асалоду!

Некаторыя далейшыя чытанні

  • Прывітанне і дабро запрашаем у цудоўны свет паслядоўнасці ДНК
  • Дзіўная ДНК: ДНК, як відаць у вачах кодэра
  • Маё ўласнае ДНК-праграмнае забеспячэнне "Antonie"